Konventionel medicinsk hydrogenperoxid kan dræbe tarmpatogener og pyogene kokker og bruges generelt til overfladedesinfektion.
Det videnskabelige navn på hydrogenperoxid er hydrogenperoxid, og dets molekyle består af 2 hydrogenatomer og 2 iltatomer. Den kemiske formel er H2O2. Det kan ses af den kemiske formel, at der er et iltatom mere i molekylet end i vandmolekylet. Hydrogenperoxid er en farveløs væske med en skarp lugt.
3% hydrogenperoxid anvendes almindeligvis til medicinsk behandling til desinfektion af sår eller otitis media. 3% brintoverilte har evnen til at desinficere og sterilisere. Fordi peroxider er ustabile, er følgende reaktioner tilbøjelige til at forekomme: H2O2 → H2O + (O) Når det møder sår på hud, mund og slimhinder, pus eller snavs, nedbrydes det straks for at generere ilt. Denne form for iltatomer, som ikke er blevet kombineret til iltmolekyler, har en stærk oxidationsevne. Når det kommer i kontakt med bakterier, kan det ødelægge bakteriecellerne og dræbe bakterierne. Hydrogenperoxid har en stærk oxiderende virkning, men koncentrationen af medicinsk hydrogenperoxid er kun 3%. Det brænder kun lidt, når det påføres huden, og overfladen oxideres til hvid. Det er nok at vaske med vand, og den originale hudfarve gendannes efter 3 til 5 minutter. Når hydrogenperoxidet desinficeres, dannes der små hvide bobler, fordi hydrogenperoxidet nedbrydes, når det møder støv og snavs på fingrene og nedbrydes for at producere vand og ilt. Efter dræbning af bakterierne er det resterende stof vand uden gift eller irritation. Danner ikke sekundær forurening. Derfor er hydrogenperoxid et ideelt desinfektionsmiddel til sårdesinfektion. Brug ikke for høj koncentration af hydrogenperoxid til desinfektion af sår for at forhindre forbrændinger på huden og det berørte område.