Hydrogenperoxid af fødevarekvalitet er et højeffektivt og bredspektret desinfektionsmiddel i rækkefølge efter desinfektionsmidler. Fordi det ikke efterlader skadelige rester efter desinfektion og sterilisering, er det blevet en sikker, grøn og sund mad.
Hydroxylmolekylerne i hydrogenperoxid af fødevarekvalitet og derivater heraf kan direkte virke på bakteriernes ydre strukturelle membran, ødelægge bakteriernes permeabilitetsbarriere og ødelægge materialebalancesystemet i og uden for bakterierne og forårsage død. De frie hydroxylmolekyler af hydrogenperoxid kan reagere direkte med mikroorganismers proteiner og nukleinsyrer, hvilket får deres struktur til at blive ødelagt og føre til døden.
Undersøgelser har også vist, at nedbrydningsprodukter af brintoverilte kan hæmme bakterielle enzym system og reagere med aminosyrer i enzymet proteinkæden.